Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEMP2A6NFY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms