Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F8A0AVK6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms