Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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