Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SCAMP1-AS1-202ENST00000513755 493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 GSG1L-205ENST00000569166 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL157392.3-201ENST00000601075 833 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AP000553.4-201ENST00000641967 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RALYL-201ENST00000517638 1972 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CDC20B-201ENST00000296733 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 C10orf128-201ENST00000374148 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC012377.1-201ENST00000499797 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TRIM64C-201ENST00000617704 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RNF17-202ENST00000255325 2134 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC022447.7-201ENST00000509629 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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