Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC055717.2-201ENST00000561864 577 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZNF483-203ENST00000358151 2433 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GRHL3-202ENST00000350501 2119 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FMO6P-202ENST00000367754 2130 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AIPL1-203ENST00000381129 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NBPF13P-201ENST00000444082 1783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BTN2A2-206ENST00000469230 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC099344.2-201ENST00000430897 1061 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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