Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL078590.3-201ENST00000607531 750 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL021408.2-201ENST00000624196 1544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL591643.1-201ENST00000561587 1900 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM107A-204ENST00000464064 2159 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RPL17P34-201ENST00000394133 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PITX2-212ENST00000614423 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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