Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC00242-201ENST00000437615 2418 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC02362-203ENST00000617323 2044 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GALNT17-205ENST00000618959 3012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 APTX-208ENST00000436040 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TNXB-203ENST00000451343 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ALDH1L1-AS2-202ENST00000500525 2236 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SCGB2B2-203ENST00000601241 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PCDHGA11-203ENST00000622044 3633 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC009716.2-201ENST00000624840 3765 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RPS6KA5-202ENST00000536315 2993 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ATP6V1H-203ENST00000396774 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC026250.1-201ENST00000500698 2311 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ADGRE3-203ENST00000443157 1971 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 WFIKKN2-201ENST00000311378 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CCDC112-202ENST00000395557 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NRAV-201ENST00000500741 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GDNF-201ENST00000326524 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ANKRD20A8P-201ENST00000432432 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PIGO-203ENST00000378617 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 QRSL1-201ENST00000369044 2158 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TMEM108-202ENST00000393130 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 C3orf20-203ENST00000435614 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC093390.1-201ENST00000426976 3403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 THUMPD1-201ENST00000381337 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 STOML3-201ENST00000379631 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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