Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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MTHFRP42898 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MTHFRP42898 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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