Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD2APQ9Y5K6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD2APQ9Y5K6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms