Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms