Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT16HQ9Y5B9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT16HQ9Y5B9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms