Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM5Q9Y4Y9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM5Q9Y4Y9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms