Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARP1Q9Y4F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms