Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KNSTRNQ9Y448 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KNSTRNQ9Y448 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms