Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF330Q9Y3S2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF330Q9Y3S2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF330Q9Y3S2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF330Q9Y3S2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF330Q9Y3S2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms