Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms