Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms