Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms