Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SARDHQ9UL12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms