Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA11Q9UKX5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms