Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM4Q9UKN5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms