Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP25Q9UHP3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms