Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFDP1Q9UEE9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms