Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-18Q9QC07 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-18Q9QC07 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms