Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL42Q9P2K6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms