Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP36Q9P275 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP36Q9P275 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms