Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLRF1Q9NZS2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLRF1Q9NZS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms