Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EHD2Q9NZN4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms