Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
BICRAQ9NZM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
BICRAQ9NZM4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
BICRAQ9NZM4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms