Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms