Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSD3Q9NYI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD3Q9NYI0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms