Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH4Q9NXW9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH4Q9NXW9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms