Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT1Q9NXH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms