Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms