Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5S1Q9NUS5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms