Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT3Q9NTG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT3Q9NTG7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms