Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPHNQ9NQX3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms