Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AKIP1Q9NQ31 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms