Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB18Q9NP72 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms