Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM8AQ9HCN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms