Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms