Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPV4Q9HBA0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms