Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms