Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIPAS39Q9H9C1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms