Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN2Q9H4D0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN2Q9H4D0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms