Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZC3H12CQ9C0D7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC3H12CQ9C0D7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms