Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms