Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A1Q9BZW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A1Q9BZW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms