Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL1Q9BYD6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL1Q9BYD6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms