Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CADM1Q9BY67 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CADM1Q9BY67 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms